Bioinformatique - 3e éd. (3° Éd.) De la séquence à la structure des protéines Coll. Sciences Sup

Langue : Français

Couverture de l’ouvrage Bioinformatique - 3e éd.

Résumé
Sommaire
Biographie

La bioinformatique a pour but d’intégrer des données d’origines très diverses pour modéliser les systèmes vivants afin de comprendre et prédire leurs comportements (analyse du génome, modélisation de l’évolution d’une population animale, modélisation moléculaire, reconstruction d’arbres phylogénétiques…).
Ce livre est axé sur la bioinformatique des protéines. Il aborde de manière simple les tâches courantes qu’un biologiste ou un biochimiste doit savoir traiter sans avoir recours au spécialiste.
Cette nouvelle édition a été enrichie de nouvelles notions comme les réseaux de neurones, les machines à vecteurs de supports, l’apprentissage profond et les alphabets structuraux.

Composition en acides aminés. Bases de données pour données de bases. Comparaison de deux séquences. Recherche dans les banques. Alignement de séquences. Bases théoriques de la phylogénie moléculaire. Algorythme pour la phylogénie moléculaire. Recherche de fonctions. Profils physico-chimiques. Prédictions de structures secondaires. Prédiction de structures 3D. Modélisation des structures 3D. Détection de sites 3D dans les protéines. Cas pratique : analyse de séquences. Cas pratique de modélisation moléculaire de protéine par homologie. Glossaire.

Professeur de Biochimie à l’Université Claude Bernard Lyon1 et chercheur à l’Institut de Biologie et de Chimie des Protéines à Lyon. Il est actuellement responsable de plusieurs UE à l’Université de Lyon dont « Introduction à la BioInformatique Structurale » (Licence de Biochimie) et « BioInformatique Structurale » (Master de Biochimie) et du module « Bioinformatique protéique » dans la filière bioinformatique et modélisation à l’INSA de Lyon. Depuis 2009, il est chargé de mission bioinformatique pour l’Institut des Sciences Biologiques du CNRS.
Manolo Gouy est directeur de recherche (Laboratoire de Biométrie et Biologie évolutive, CNRS, université Claude Bernard Lyon 1).
Alexandre de Brevern est directeur de recherche au laboratoire dynamique des structures et interactions des macromolécules biologiques (INSERM, Université de Paris).