Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique (3° Éd.) 3e édition revue et augmentée Coll. Savoir faire
Auteurs : Tagu Denis, Jaubert-Possamai Stéphanie, Méreau Agnès
Avant-propos
Remerciements
Liste des rédacteurs
Partie 1
Les bases
Fiche 1. Structure et expression d’un gène
eucaryote codant un ARNm et une protéine
Fiche 2. Définition des
ARN non codants
Fiche 3. Paramètres de description d’un génome
Fiche
4. Enzymes de restriction
Fiche 5. Électrophorèse des acides
nucléiques
Fiche 6. PCR (Polymerase Chain Reaction)
Fiche 7.
Description d’un plasmide et d’un phagemide
Fiche 8.
Description d’un YAC et autres grands vecteurs
Fiche 9. Clonage
moléculaire
Fiche 10. Transformation génétique des bactéries et
des levures
Fiche 11. Construction de banques d’acides nucléiques
Fiche
12. Extraction d’ADN
Fiche 13. Extraction d’ARN
Fiche
14. Marquage des acides nucléiques (ADN et ARN)
Fiche 15.
Hybridation moléculaire
Fiche 16. Hybridation in situ d’ARN
Fiche
17. La cytogénétique moléculaire : FISH, GISH
Fiche
18. Électrophorèse en champ pulsé
Partie 2
Caractérisation d’un gène
Fiche 19.
Séquençage d’ADN par la technique Sanger
Fiche 20.
RT-PCR (Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction)
Fiche 21.
PCR quantitative
Fiche 22. Amplification rapide d’extrémités d’ADNc :
RACE
Fiche 23. Transcription in vitro
Fiche 24. Détermination du
site d’initiation de la transcription
Fiche 25. Gel-retard
Fiche
26. Production de protéines recombinantes
Fiche 27. Système du
double hybride
Partie 3
Analyse de la fonction d’un gène par mutagenèse ou
transgenèse
Fiche 28. Grands principes de la transgenèse et de
la mutagenèse
Fiche 29. Transfert de gènes
Fiche 30.
Transgenèse chez la souris
Fiche 31. Analyse de la fonction d’un
gène par mutagenèse ou transgenèse chez les poissons
Fiche
32. Transgenèse chez Drosophila melanogaster
Fiche 33.
Transgenèse de Caenorhabditis elegans
Fiche 34. Transgenèse
stable des plantes par les agrobactéries
Fiche 35. Techniques de
ARNi (ARN interférence)
Fiche 36. Transformation des plantes par
agro-infiltration par Agrobacterium tumefaciens
Fiche 37. Analyse
fonctionnelle de promoteurs
Fiche 38. Mutagenèse chimique du génome
de drosophile
Fiche 39. Mutagenèse d’insertion
Fiche
40. Le TILLING (Targeting-Induced Local Lesions IN Genomes)
Fiche 41.
Mutagenèse dirigée par le système CRISPR-Cas9
Partie 4
Approches haut débit
Fiche 42. Séquencer un génome :
généralités
Fiche 43. Séquençage d’ADN par la
technique Illumina
Fiche 44. Séquençage d’ADN par la technique Single
Molecule Real Time (SMRT) : PacBio
Fiche 45. Séquençage d’ADN grande
longueur par la technique Nanopore
Fiche 46. Séquençage d’ADN par la
technique Ion Torrent™
Fiche 47. Séquençage d’ADN grande
longueur « synthétique » par la technique 10X Genomics®
Fiche
48. Cartographie optique de génomes (Optical Mapping)
Fiche 49.
La capture d’exons
Fiche 50. Métagénomique et
métatranscriptomique
Fiche 51. Barcoding et métabarcoding
Fiche
52. Analyse des données RNA-seq (RNA sequencing)
Fiche 53.
Interactions protéines-ARN à la résolution du nucléotide (iCLIP)
Fiche
54. Méthodes d’analyse du traductome
Fiche 55. Structure
de la chromatine : introduction
Fiche 56. Immunoprécipitation de la
chromatine (ChIP)
Fiche 57. Analyse tridimensionnelle de la
chromatine par Chromosome Conformation Capture : les techniques 3C,
4C-seq et Hi-C
Fiche 58. Techniques d’identification de régions
génomiques accessibles à des régulateurs : FAIRE et ATAC
Fiche
59. Méthode de détermination du positionnement des nucléosomes : MAINE
Fiche
60. La méthylation de l’ADN
Partie 5
Étude du polymorphisme d’un génome
Fiche
61. Les principaux types de polymorphisme
Fiche 62. Microsatellites,
répétitions de séquences simples : SSR
Fiche 63.
Génotypage SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
Fiche 64.
Utilisation des polymorphismes : QTL, GWAS et scans Génomiques
Fiche
65. Détermination du polymorphisme par séquençage de nouvelle génération
Fiche
66. Approches populationnelles par séquençage en pools (Pool-Seq)
Fiche
67. Détection génomique de CNV par nouvelles technologies de séquençage
Fiche
68. Étude du polymorphisme par séquençage d’ADN associé à des sites de
restriction (RAD-seq)
Fiche 69. Génotypage par séquençage : GBS
(Genotyping By Sequencing)
Partie 6
Bioanalyses
Fiche 70. Assemblage de génomes
Fiche
71. Annotation de génomes
Fiche 72. Galaxy
Fiche 73. La
programmation
Date de parution : 11-2018
Ouvrage de 312 p.
16x24 cm