Architecture des plantes et production végétale Les apports de la modélisation mathématique Coll. Synthèses

Préface de Franck Varenne

I - Modélisation du développement de l’architecture des plantes
1 - Notions botaniques sur l’organisation des structures végétales - Sylvie Sabatier, Daniel Barthélémy, Philippe de Reffye
2 - Les équations du fonctionnement et de la production des méristèmes - Philippe de Reffye
3 – Simulations des structures et des architectures végétales - BaoGang Hu, Daniel Barthélémy, Philippe de Reffye
4 - Dénombrement des phytomères produits par les structures végétales : les opérateurs du développement - Philippe de Reffye, MengZhen Kang

II - Modélisation de la croissance de l’architecture des plantes
5 - Modélisation de la croissance végétale, les opérateurs de croissance, cas déterministe - Philippe de Reffye, Ep Heuvelink, Véronique Letort, MengZhen Kang
6 - Modélisation de la croissance végétale, les opérateurs de croissance, cas stochastique - Philippe de Reffye, MengZhen Kang
7 - Modélisation de l’acropétalie et de la basipétalie chez les plantes herbacées - MengZhen Kang, Philippe de Reffye
8 - La croissance secondaire - Véronique Letort, Francois Houllier, Philippe de Reffye, Frédéric Blaise
9 - Interaction croissance développement - Amélie Mathieu, Philippe de Reffye
10 - Fertilité des fleurs et production de graines - Philippe de Reffye

III- Applications du modèle GreenLab ou comment mieux étudier les plantes
11 - Méthodes inverses et identification paramétrique de modèles d’architecture végétale - Philippe de Reffye, Francois Houllier, Paul-Henry Cournède
12 - Validation du modèle GreenLab sur les plantes cultivées - BaoGui Zhang, Guo Yan, Ep Heuvelink, Hervé Rey, Philippe de Reffye
13 – Le passage de la plante au peuplement - Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
14 – Des variantes possibles sur la formulation des fonctions sources-puits - Philippe de Reffye, BaoGui Zhang, Véronique Letort, MengZhen Kang
15 – Calibration, implémentation et mise en œuvre de GreenLab - Marc Jaeger

IV - Applications agronomiques et perpectives dans les autres domaines
16 – Modèles pour la représentation et la visualisation des plantes et des paysages - Marc Jaeger, Gérard Subsol
17 – Applications diverses de l’architecture des plantes - Philippe de Reffye, Marc Jaeger

Philippe de Reffye est ingénieur agronome et docteur en génétique et amélioration des plantes. Il a créé et dirigé des équipes pluri disciplinaires en France au Cirad, à l’Inria et à l’ECP et en Chine à l’Institut d’automatique de Pékin. En 2016, il a reçu la médaille d’or de l’Académie d’agriculture de France pour l’ensemble de ses recherches sur la croissance des plantes.

Marc Jaeger est docteur en informatique, spécialisé en imagerie. Chercheur au Cirad, il travaille sur la transcription de modèles mathématiques vers la simulation de plantes et paysages et leurs représentations en images de synthèse.

Daniel Barthélémy est docteur en biologie et écologie végétale, botaniste et spécialiste des plantes tropicales et de l’architecture des végétaux. Il a dirigé l’unité mixte de recherche Amap de 2001 à 2010, avant d’assurer la direction du département Systèmes biologiques du Cirad.

François Houllier est polytechnicien, spécialiste de la modélisation en biologie et écologie. Il est l’un des cofondateurs des modèles de l’unité Amap. Il a dirigé l’Inra de 2014 à 2016. Il est président de l’Université Sorbonne Paris Cité.

Franck Varenne Maître de conférences en épistémologie, université de Rouen Normandie Unité mixte de recherche IHPST (UMR 8590)