Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique (3° Éd.) 3e édition revue et augmentée Coll. Savoir faire
Auteurs : Tagu Denis, Jaubert-Possamai Stéphanie, Méreau Agnès
Avant-propos
Remerciements
Liste des rédacteurs
Partie 1
Les bases
Fiche 1. Structure et expression d’un gène eucaryote codant un ARNm et une protéine
Fiche 2. Définition des ARN non codants
Fiche 3. Paramètres de description d’un génome
Fiche 4. Enzymes de restriction
Fiche 5. Électrophorèse des acides nucléiques
Fiche 6. PCR (Polymerase Chain Reaction)
Fiche 7. Description d’un plasmide et d’un phagemide
Fiche 8. Description d’un YAC et autres grands vecteurs
Fiche 9. Clonage moléculaire
Fiche 10. Transformation génétique des bactéries et des levures
Fiche 11. Construction de banques d’acides nucléiques
Fiche 12. Extraction d’ADN
Fiche 13. Extraction d’ARN
Fiche 14. Marquage des acides nucléiques (ADN et ARN)
Fiche 15. Hybridation moléculaire
Fiche 16. Hybridation in situ d’ARN
Fiche 17. La cytogénétique moléculaire : FISH, GISH
Fiche 18. Électrophorèse en champ pulsé
Partie 2
Caractérisation d’un gène
Fiche 19. Séquençage d’ADN par la technique Sanger
Fiche 20. RT-PCR (Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction)
Fiche 21. PCR quantitative
Fiche 22. Amplification rapide d’extrémités d’ADNc : RACE
Fiche 23. Transcription in vitro
Fiche 24. Détermination du site d’initiation de la transcription
Fiche 25. Gel-retard
Fiche 26. Production de protéines recombinantes
Fiche 27. Système du double hybride
Partie 3
Analyse de la fonction d’un gène par mutagenèse ou transgenèse
Fiche 28. Grands principes de la transgenèse et de la mutagenèse
Fiche 29. Transfert de gènes
Fiche 30. Transgenèse chez la souris
Fiche 31. Analyse de la fonction d’un gène par mutagenèse ou transgenèse chez les poissons
Fiche 32. Transgenèse chez Drosophila melanogaster
Fiche 33. Transgenèse de Caenorhabditis elegans
Fiche 34. Transgenèse stable des plantes par les agrobactéries
Fiche 35. Techniques de ARNi (ARN interférence)
Fiche 36. Transformation des plantes par agro-infiltration par Agrobacterium tumefaciens
Fiche 37. Analyse fonctionnelle de promoteurs
Fiche 38. Mutagenèse chimique du génome de drosophile
Fiche 39. Mutagenèse d’insertion
Fiche 40. Le TILLING (Targeting-Induced Local Lesions IN Genomes)
Fiche 41. Mutagenèse dirigée par le système CRISPR-Cas9
Partie 4
Approches haut débit
Fiche 42. Séquencer un génome : généralités
Fiche 43. Séquençage d’ADN par la technique Illumina
Fiche 44. Séquençage d’ADN par la technique Single Molecule Real Time (SMRT) : PacBio
Fiche 45. Séquençage d’ADN grande longueur par la technique Nanopore
Fiche 46. Séquençage d’ADN par la technique Ion Torrent™
Fiche 47. Séquençage d’ADN grande longueur « synthétique » par la technique 10X Genomics®
Fiche 48. Cartographie optique de génomes (Optical Mapping)
Fiche 49. La capture d’exons
Fiche 50. Métagénomique et métatranscriptomique
Fiche 51. Barcoding et métabarcoding
Fiche 52. Analyse des données RNA-seq (RNA sequencing)
Fiche 53. Interactions protéines-ARN à la résolution du nucléotide (iCLIP)
Fiche 54. Méthodes d’analyse du traductome
Fiche 55. Structure de la chromatine : introduction
Fiche 56. Immunoprécipitation de la chromatine (ChIP)
Fiche 57. Analyse tridimensionnelle de la chromatine par Chromosome Conformation Capture : les techniques 3C, 4C-seq et Hi-C
Fiche 58. Techniques d’identification de régions génomiques accessibles à des régulateurs : FAIRE et ATAC
Fiche 59. Méthode de détermination du positionnement des nucléosomes : MAINE
Fiche 60. La méthylation de l’ADN
Partie 5
Étude du polymorphisme d’un génome
Fiche 61. Les principaux types de polymorphisme
Fiche 62. Microsatellites, répétitions de séquences simples : SSR
Fiche 63. Génotypage SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
Fiche 64. Utilisation des polymorphismes : QTL, GWAS et scans Génomiques
Fiche 65. Détermination du polymorphisme par séquençage de nouvelle génération
Fiche 66. Approches populationnelles par séquençage en pools (Pool-Seq)
Fiche 67. Détection génomique de CNV par nouvelles technologies de séquençage
Fiche 68. Étude du polymorphisme par séquençage d’ADN associé à des sites de restriction (RAD-seq)
Fiche 69. Génotypage par séquençage : GBS (Genotyping By Sequencing)
Partie 6
Bioanalyses
Fiche 70. Assemblage de génomes
Fiche 71. Annotation de génomes
Fiche 72. Galaxy
Fiche 73. La programmation
Date de parution : 11-2018
Ouvrage de 312 p.
16x24 cm